传说中的洪荒时代，随着神帝的去世，金、木、水、火、土五族纷纷开始蠢蠢欲动。就在这个波涛汹涌的动荡时代，几位少年横空出世：龙神太子拓拔野，蜃楼城少城主蚩尤，……于机缘巧合下开始了一段惊心动魄的传奇历程。
《搜神记》从水族阴谋开始，以木族、土族、火族、金族的顺序依次展开，分别展现了青黄赤白黑五帝不同的气质特征：青帝的孤傲难测，赤帝的刚愎自用，白帝的淡泊超脱和黑帝的满腹愁恨，将一个远古时期的大荒全貌跃然在观众面前。
本剧主人公拓拔野从一个流浪山野的顽童，顺应天意遇见神农，遵其遗命前往蜃楼城，在城中与蚩尤一见如故，成为好友，蜃楼一夜倾城之际隐约引出水妖烛龙将要一统大荒的阴谋。拓拔野于东海苦练四年，成为龙神太子。在追寻负气出走的纤纤的途中，无意中撞破水族的阴谋。为解救卷入此中的纤纤，拓拔野又奋不顾身前往土族取七彩土意图修复火族圣杯，中途又帮助土族太子巧解土族内乱危机。赌气的纤纤再次出走，拓拔野与蚩尤二度追寻，于寒荒大地再破水族分裂金族的阴谋，但翻天印已启寒荒大灾。群雄会于昆仑山蟠桃会，水妖烛龙正和盘托出阴谋之时，不料多年前受其陷害的黑帝率领鬼兵突袭蟠桃盛会，意图一网打尽天下英雄以报当日之仇……
